生物大数据

“大数据”是时下最火热的词汇,是各行业人士争相追捧的利润焦点。自1977年2月,Sanger与他的同事发表了第一个生物体的完整基因组序列以来,生物学大数据时代也宣告来临。生物学大数据技术的战略意义不在…

国家精品生物数据科学
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福建农林大学
中国大学MOOC
  • 完成时间大约为 15
  • 简单(初级)
  • 中文
注:因开课平台的各种因素变化,以上开课日期仅供参考

课程概况

由省级优秀教师、中科院专家及上市企业技术专家担纲主讲,系统介绍当前生命科学研究及资本追逐的热词—生物大数据,讲授其所蕴含的价值与挖掘利用技术。课程特色之一是内容新颖。本课程是应生物基因组测序技术的发展而创建,面向新一代测序技术所获得的生物大数据,国内外尚无同类课程上线,而一些大型公司更是将其作为高端收费类培训课程。课程特色之二是主讲教师结构合理。由高校教师、中科院研究人员和企业技术人员组成,强强联合、优势互补,使课程内容既具理论高度,又具实用价值。课程特色之三是兼具通识与专业。本课程涵盖通识类知识点和专业类知识点,通识类知识有助于大众学生了解生物大数据的特点、价值与应用,专业类知识帮助学生掌握生物大数据的分析技能。

课程大纲

第一章 绪论

第一节 大数据的特征与价值

第二节 生物学大数据基本概念
BBC纪录片 人类面对大数据

第一章测验

第二章 核酸数据库

第一节 DNA序列数据库

第二节 NCBI数据库检索策略

第二章测试

第三章 蛋白质数据库

第一节 蛋白质数据库概览

第二节 蛋白质序列数据库

第三节 蛋白质模式和域的数据库

第四节 蛋白质结构数据库

第五节 蛋白质分类数据库

第三章 课件

第三章测试题

第四章 基因组测序技术

第一节 基因组测序技术

第二节 基因组测序方式与质量控制

第三节 基因组测序的组装技术

第四节 转录组测序与分析

第五节 宏基因组测序与分析

第六节 基因组测序技术的应用:来自华大的案例

第四章测试

第五章 上机实操

第一节 RNA-Seq数据分析

第二节 基因组重测序数据分析

预备知识

普通生物学、生物化学

参考资料

《生物信息学》 第二版 陈铭 科学出版社
《生物信息学》 樊龙江 著
《生物信息学》(第2版)李霞,雷健波,李亦学 等 编
《大数据时代》[英] 维克托·迈尔-舍恩伯格,[英] 肯尼思·库克耶 著;盛杨燕,周涛 译

常见问题

Q :   昵称如何设置?
A :  需要根据学校要求设置,一般用学校名称_姓名_学号进行注册,便于统计成绩
Q :  作业能手机作答吗?
A :  务必用电脑作答提交,手机作答可能会导致错误提交失败
Q :  作业一般什么时候发布?
A :  作业在课程视频发布后3小时就会发布
Q :  作业要在多久时间内完成?
A :  作业提交时间(除第一次作业外)截止到下次视频发布时间,也就是下次视频发布前完成,否则影响期末总分;最后一次作业请在期末测试发布时间前完成
Q :  错过了测试和期末时间怎么办?
A :  请关注各个章节的发布时间,错过了就不能再次答题;每个单元测验都有3次机会,取最高分;期末考试只有1次机会,均需登陆电脑进行作答
Q :  视频学习页面打不开怎么办?
A :  有些浏览器可能不兼容,推荐使用chrome浏览器。如有点开学习页面,但显示为空白的情况,请点击鼠标右键,刷新几次,就会出现内容

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