生物信息学方法 II

Bioinformatic Methods II

生物数据分析的(主要基于网络的)程序应用,这是生物信息学初级课程的第二部,着重实践方法的研究,虽涉及一些理论知识,但重点在于利用当前的生物信息学工具进行数据分析,生成生物学假说。

多伦多大学

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课程概述

大规模生物项目,如人类基因组测序,利用RNA序列、微阵列和其他科学技术的基因表达研究,已经为生物学家创建了丰富的数据资料。但是对科学家来说,对数据进行分析、并从中提取与研究项目相关的有用信息却是现在面临的一大挑战。本课程侧重于生物数据分析的实际操作,以及利用现存的生物信息资源,主要通过基于网络的应用程序和数据库访问大量数据,解答生物学家的一般性问题。

课程分为两个独立部分,内容包括多序列对比、系统发生学、基因表达的数据分析和蛋白质相互作用网络。

第一部分课程,生物信息学方法一,主要研究数据库、Blast、多序列对比、系统发生学、选择分析和宏基因组学。

第二部分课程, 生物信息学方法二,主讲基序检索、蛋白质相互作用、结构生物信息学、基因表达的数据分析和顺式元件预测。

整套课程对考虑攻读生物科学和分子医学研究生的学生均有所帮助。

课程大纲

生物信息学方法二
第一周:蛋白质基序
第二周: 蛋白质相互作用
第三周:蛋白质结构
第四周: 基因表达 分析(一)
第五周: 基因表达 分析(二)
第六周:顺式调控元件

背景知识

建议具备一定的分子生物学知识,上过大二相关课题的初级课程。

授课形式

每周包含20分钟的导读课程,涉及一些生物学背景和这一周要研究的生物信息学工具背后的相关理论,然后在电脑上进行实验操作。另外,安排两次测验和一次课外作业,课外作业为必做项目。

常见问题

学习这门课,我需要先选修生物信息学方法的第一部分课程吗?
无需选修生物信息学方法的第一部分课程,如果需要的话,本课程可以为学生提供相关内容的查阅和回顾。

学完这门课,我能得到结课证书吗?
凡顺利完成本课程的学生均可获得由授课老师签发的结课证书。

选修这门课需要准备什么?
有电脑,能上网,有时间完成课上布置的实验。

学完这门课,我最大的收获是什么?
了解富于趣味性的数据集和相关工具,探索从千米级到纳米级的各种生物数据。

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